Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2f6O54917 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f6O54917 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f6O54917 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f6O54917 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f6O54917 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms