Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf5O35445 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms