Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-ObO35424 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165 ms