Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm7980L7N471 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm7980L7N471 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms