Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8720K9J7F4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8720K9J7F4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8720K9J7F4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8720K9J7F4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms