Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r194J3JS27 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms