Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4aF8VPX6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms