Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rfx7F8VPJ6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rfx7F8VPJ6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rfx7F8VPJ6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms