Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Trappc8E9PWG2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trappc8E9PWG2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms