Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms