Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc78D3Z5T1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc78D3Z5T1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc78D3Z5T1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms