Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Catsperg2C6KI89 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg2C6KI89 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms