Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Svep1A2AVA0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms