Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a3A2ACT7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a3A2ACT7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a3A2ACT7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a3A2ACT7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a3A2ACT7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col9a3A2ACT7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a3A2ACT7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms