Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms