Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700019A02RikA0A087WPV9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700019A02RikA0A087WPV9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms