Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubl3Q9Z2M6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms