Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cry2Q9R194 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cry2Q9R194 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms