Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Six6Q9QZ28 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms