Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod4Q9JLH8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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