Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Extl1Q9JKV7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Extl1Q9JKV7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms