Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3glb1Q9JK48 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms