Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx20Q9JJY4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms