Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Bco1Q9JJS6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Bco1Q9JJS6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Bco1Q9JJS6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Bco1Q9JJS6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bco1Q9JJS6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Bco1Q9JJS6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Bco1Q9JJS6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Bco1Q9JJS6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Bco1Q9JJS6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Bco1Q9JJS6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Bco1Q9JJS6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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