Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms