Protein–RNA interactions for Protein: Q9JID9

Sh2b2, SH2B adapter protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b2Q9JID9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sh2b2Q9JID9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh2b2Q9JID9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms