Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms