Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SrpraQ9DBG7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms