Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930548H24RikQ9D496 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930548H24RikQ9D496 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms