Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Serpinb3bQ9D1Q5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serpinb3bQ9D1Q5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms