Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ska1Q9CPV1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms