Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms