Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5rap3Q99LM2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5rap3Q99LM2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms