Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk4Q8VEJ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk4Q8VEJ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms