Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol9aQ8VDU3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apol9aQ8VDU3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.2 ms