Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam20bQ8VCS3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms