Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700001C19RikQ8K168 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700001C19RikQ8K168 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms