Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atad2Q8CDM1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atad2Q8CDM1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms