Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alx1Q8C8B0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alx1Q8C8B0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms