Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nek11Q8C0Q4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek11Q8C0Q4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek11Q8C0Q4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
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