Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snapc4Q8BP86 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snapc4Q8BP86 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms