Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 678 ms