Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NipblQ6KCD5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NipblQ6KCD5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms