Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nlrp4eQ66X19 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms