Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nlrp9cQ66X01 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp9cQ66X01 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp9cQ66X01 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms