Protein–RNA interactions for Protein: Q66L44

Cbarp, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbarpQ66L44 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbarpQ66L44 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CbarpQ66L44 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms