Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Knl1Q66JQ7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Knl1Q66JQ7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms