Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms