Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zic3Q62521 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms