Protein–RNA interactions for Protein: Q61712

Dnajc1, DnaJ homolog subfamily C member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc1Q61712 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc1Q61712 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc1Q61712 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms